Las líneas de acción del FEIG son:

• Prevenir, controlar y erradicar especies introducidas en Galápagos.
• Restaurar los ecosistemas afectados.
• Educación y comunicación.

Los proyectos e iniciativas financiadas por el FEIG, se alinean a las siete estrategias del Plan de Manejo de Especies Invasoras de Galápagos:

• Bioseguridad
• Manejo de Especies Invasoras Prioritarias
• Restauración
• Salud
• Sistemas de Gestión de Información
• Comunicación, Educación Ambiental y Participación para el Manejo de Especies Invasoras.
• Fortalecimiento Institucional para el Manejo de Especies Invasoras